MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 68571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021081	ACG	2	6	200300	200305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_021081	CAG	2	6	200355	200360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_021081	GGC	2	6	200452	200457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881851
4504	NC_021081	CA	3	6	200534	200539	50 %	0 %	0 %	50 %	482881851
4505	NC_021081	CAC	2	6	200551	200556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881851
4506	NC_021081	GCC	2	6	200631	200636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881851
4507	NC_021081	ACG	2	6	200642	200647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881851
4508	NC_021081	GCG	2	6	200665	200670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_021081	TGG	2	6	200672	200677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881852
4510	NC_021081	TGC	2	6	200684	200689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
4511	NC_021081	CGG	2	6	200745	200750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881852
4512	NC_021081	CTG	2	6	200809	200814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
4513	NC_021081	GTG	2	6	200824	200829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881852
4514	NC_021081	TGG	2	6	200830	200835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881852
4515	NC_021081	TGGC	2	8	200838	200845	0 %	25 %	50 %	25 %	482881852
4516	NC_021081	GCG	2	6	200874	200879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881852
4517	NC_021081	ATG	2	6	200893	200898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881852
4518	NC_021081	CCTT	2	8	200951	200958	0 %	50 %	0 %	50 %	482881852
4519	NC_021081	TCT	2	6	200972	200977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881852
4520	NC_021081	GCC	2	6	200983	200988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881852
4521	NC_021081	CAC	2	6	200997	201002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881852
4522	NC_021081	CTGG	2	8	201010	201017	0 %	25 %	50 %	25 %	482881852
4523	NC_021081	TGGA	2	8	201022	201029	25 %	25 %	50 %	0 %	482881852
4524	NC_021081	CGGG	2	8	201051	201058	0 %	0 %	75 %	25 %	482881852
4525	NC_021081	GCT	2	6	201069	201074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
4526	NC_021081	G	8	8	201107	201114	0 %	0 %	100 %	0 %	482881852
4527	NC_021081	AGG	2	6	201116	201121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881852
4528	NC_021081	GGT	2	6	201141	201146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881852
4529	NC_021081	GTG	2	6	201199	201204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881852
4530	NC_021081	G	6	6	201289	201294	0 %	0 %	100 %	0 %	482881852
4531	NC_021081	CTG	2	6	201466	201471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
4532	NC_021081	CTT	2	6	201489	201494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881852
4533	NC_021081	GCCCTG	2	12	201562	201573	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	482881852
4534	NC_021081	GCC	2	6	201610	201615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881852
4535	NC_021081	CGG	2	6	201659	201664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881852
4536	NC_021081	CTG	2	6	201737	201742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
4537	NC_021081	CTG	2	6	201763	201768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
4538	NC_021081	GGC	2	6	201774	201779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881852
4539	NC_021081	GCA	2	6	201798	201803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881852
4540	NC_021081	GCGG	2	8	201825	201832	0 %	0 %	75 %	25 %	482881852
4541	NC_021081	GGA	2	6	201864	201869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881852
4542	NC_021081	GTG	2	6	201895	201900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881852
4543	NC_021081	CAA	2	6	201933	201938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881852
4544	NC_021081	CTG	2	6	202001	202006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
4545	NC_021081	GCT	2	6	202045	202050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
4546	NC_021081	GTG	2	6	202054	202059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881852
4547	NC_021081	AGCG	2	8	202091	202098	25 %	0 %	50 %	25 %	482881852
4548	NC_021081	CCG	2	6	202152	202157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881852
4549	NC_021081	CCG	2	6	202160	202165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881852
4550	NC_021081	TGC	2	6	202211	202216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
4551	NC_021081	GGA	2	6	202218	202223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881852
4552	NC_021081	GCC	2	6	202228	202233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881852
4553	NC_021081	CCG	2	6	202364	202369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881852
4554	NC_021081	GGT	2	6	202371	202376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881852
4555	NC_021081	GAA	2	6	202383	202388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881852
4556	NC_021081	CCG	2	6	202394	202399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881852
4557	NC_021081	GGC	2	6	202464	202469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881852
4558	NC_021081	ACA	2	6	202514	202519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881852
4559	NC_021081	CTG	3	9	202528	202536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
4560	NC_021081	GCG	2	6	202549	202554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881852
4561	NC_021081	TGA	2	6	202559	202564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881852
4562	NC_021081	CTG	3	9	202597	202605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881852
4563	NC_021081	TGC	2	6	202712	202717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881853
4564	NC_021081	AAG	2	6	202769	202774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881853
4565	NC_021081	CCA	2	6	202793	202798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881853
4566	NC_021081	TGCTGA	2	12	202922	202933	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482881853
4567	NC_021081	GAA	2	6	202945	202950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881853
4568	NC_021081	GAC	2	6	202984	202989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881853
4569	NC_021081	GGT	2	6	203019	203024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881853
4570	NC_021081	CTA	2	6	203041	203046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881853
4571	NC_021081	CTG	3	9	203161	203169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881853
4572	NC_021081	GTG	2	6	203257	203262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881853
4573	NC_021081	GCG	2	6	203336	203341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881853
4574	NC_021081	ATG	2	6	203364	203369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881853
4575	NC_021081	TGGT	2	8	203394	203401	0 %	50 %	50 %	0 %	482881854
4576	NC_021081	TGG	2	6	203407	203412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881854
4577	NC_021081	TGG	2	6	203416	203421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881854
4578	NC_021081	GAT	2	6	203480	203485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881854
4579	NC_021081	CTGG	2	8	203561	203568	0 %	25 %	50 %	25 %	482881854
4580	NC_021081	CTGG	2	8	203609	203616	0 %	25 %	50 %	25 %	482881854
4581	NC_021081	CGA	3	9	203711	203719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881854
4582	NC_021081	AAC	2	6	203776	203781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881854
4583	NC_021081	CTG	2	6	203793	203798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881854
4584	NC_021081	C	6	6	203824	203829	0 %	0 %	0 %	100 %	482881854
4585	NC_021081	GC	3	6	203833	203838	0 %	0 %	50 %	50 %	482881854
4586	NC_021081	GCC	2	6	203876	203881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881854
4587	NC_021081	GCC	2	6	203926	203931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881854
4588	NC_021081	GGT	2	6	203993	203998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881854
4589	NC_021081	CTT	2	6	204088	204093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881854
4590	NC_021081	ACA	2	6	204125	204130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881854
4591	NC_021081	GGAGG	2	10	204177	204186	20 %	0 %	80 %	0 %	482881854
4592	NC_021081	CAC	2	6	204213	204218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881854
4593	NC_021081	TG	5	10	204228	204237	0 %	50 %	50 %	0 %	482881854
4594	NC_021081	GCC	2	6	204313	204318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881854
4595	NC_021081	GATA	2	8	204494	204501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_021081	CA	3	6	204515	204520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_021081	ACT	2	6	204564	204569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881855
4598	NC_021081	AGCC	2	8	204690	204697	25 %	0 %	25 %	50 %	482881855
4599	NC_021081	GCC	2	6	204700	204705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881855
4600	NC_021081	GGC	2	6	204727	204732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881855
4601	NC_021081	CTG	2	6	204745	204750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881855
4602	NC_021081	ACC	2	6	204821	204826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881855
4603	NC_021081	AACC	2	8	204837	204844	50 %	0 %	0 %	50 %	482881855
4604	NC_021081	CGG	2	6	204947	204952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881855
4605	NC_021081	AGG	2	6	205157	205162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881855
4606	NC_021081	CTA	2	6	205257	205262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881855
4607	NC_021081	CTG	2	6	205348	205353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881855
4608	NC_021081	CAGG	2	8	205393	205400	25 %	0 %	50 %	25 %	482881855
4609	NC_021081	GAT	3	9	205440	205448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881855
4610	NC_021081	GGGATG	2	12	205459	205470	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	482881855
4611	NC_021081	ATC	2	6	205475	205480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881855
4612	NC_021081	ATG	3	9	205537	205545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881855
4613	NC_021081	GCC	2	6	205559	205564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881855
4614	NC_021081	TCG	2	6	205583	205588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881855
4615	NC_021081	CTAC	2	8	205615	205622	25 %	25 %	0 %	50 %	482881855
4616	NC_021081	CGC	2	6	205672	205677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881855
4617	NC_021081	ATG	2	6	205696	205701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881855
4618	NC_021081	TCA	2	6	205715	205720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881855
4619	NC_021081	TAA	2	6	205794	205799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881855
4620	NC_021081	AC	3	6	205827	205832	50 %	0 %	0 %	50 %	482881855
4621	NC_021081	GTG	2	6	205918	205923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881855
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4623	NC_021081	TCG	2	6	205979	205984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881855
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4737	NC_021081	ACCCC	2	10	210907	210916	20 %	0 %	0 %	80 %	482881860
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4742	NC_021081	GCCTGA	2	12	211189	211200	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482881860
4743	NC_021081	CCCGC	2	10	211201	211210	0 %	0 %	20 %	80 %	482881860
4744	NC_021081	GGT	3	9	211214	211222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881860
4745	NC_021081	TGGC	2	8	211245	211252	0 %	25 %	50 %	25 %	482881860
4746	NC_021081	ACC	2	6	211272	211277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881860
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4771	NC_021081	GGT	2	6	212445	212450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4772	NC_021081	CGA	2	6	212486	212491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4801	NC_021081	CTGG	2	8	213457	213464	0 %	25 %	50 %	25 %	482881862
4802	NC_021081	GAAG	2	8	213602	213609	50 %	0 %	50 %	0 %	482881862
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4866	NC_021081	TGT	2	6	216313	216318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881866
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4885	NC_021081	CGGCC	2	10	216995	217004	0 %	0 %	40 %	60 %	482881868
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4962	NC_021081	GCCTGC	2	12	220358	220369	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	482881869
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4964	NC_021081	AG	3	6	220454	220459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4982	NC_021081	ACG	2	6	221242	221247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881870
4983	NC_021081	CTG	2	6	221250	221255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881870
4984	NC_021081	AGCC	2	8	221328	221335	25 %	0 %	25 %	50 %	482881870
4985	NC_021081	T	7	7	221452	221458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4986	NC_021081	GGC	2	6	221552	221557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871
4987	NC_021081	CTG	3	9	221581	221589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
4988	NC_021081	GCT	2	6	221598	221603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
4989	NC_021081	TGC	2	6	221606	221611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
4990	NC_021081	CTTTC	2	10	221650	221659	0 %	60 %	0 %	40 %	482881871
4991	NC_021081	TGGG	2	8	221692	221699	0 %	25 %	75 %	0 %	482881871
4992	NC_021081	TGC	2	6	221720	221725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
4993	NC_021081	GCT	2	6	221805	221810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881871
4994	NC_021081	GGC	2	6	221811	221816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871
4995	NC_021081	TGG	2	6	221822	221827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881871
4996	NC_021081	GGCGT	2	10	221842	221851	0 %	20 %	60 %	20 %	482881871
4997	NC_021081	TTC	2	6	221866	221871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881871
4998	NC_021081	ACC	2	6	221875	221880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881871
4999	NC_021081	ACCG	2	8	221886	221893	25 %	0 %	25 %	50 %	482881871
5000	NC_021081	GGC	2	6	221898	221903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881871

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